毛細管電泳是電泳的分析分離技術。毛細管電泳是一種高分辨率分離技術。離子的分離基于施加電壓下離子的電泳遷移率。離子的遷移或遷移取決于一些因素，包括離子的電荷，粘度，原子的大小或其半徑。
 
顆粒的遷移速率與所施加的電場成比例。所以離子的遷移率隨著場強的增加而增加。只有離子遷移而中性物質不受影響。較小的離子因其較小的尺寸而具有較高的遷移率，因此它們以較小的摩擦移動。